Вредные бактерии, живые в здоровых телах, не вызывая болезнь

здоровый

Ученые, работающие над огромным проектом, картировавшим все различные микроорганизмы, живущие в и на здоровом человеческом теле, сделали многозамечательные открытия, включая факт, что вредные бактерии могут жить в здоровых телах и сосуществовать с их хозяином и другими микроорганизмами без порожденияболезнь.Эта неделя видит публикацию нескольких бумаг из Человеческого проекта микробиома (HMP), включая два по своей природе и два в PLoS ОДИН.Микробиом

Микробиом является суммой всех микроорганизмов, колонизирующих тело: это включает триллионы микроорганизмов, превосходящих численностью клетки человека на от 10 до 1. Микроорганизмынаселяйте каждый укромный уголок и трещину тела, и большую часть времени отношение является дружественным, потому что они помогают еде обзора, усиливают иммунную системуи отбейте опасные инфекционные агенты.Колорадский университет (CU) – Адъюнкт-профессор Валуна Роб Найт из Института BioFrontiers является соавтором на двух бумагах Природы. Он сказал прессуто, что микробиом может только составить 1 – 3% массы человеческого тела, но это играет ключевую роль в здоровье человека.Одна из захватывающих особенностей микробиома – то, что различные локализации на теле имеют различный communites микроорганизмов, столь же отличающихся друг от другакак различия между микробными сообществами в океанах и пустынях.

Найт сказал:«Лучшим пониманием этого микробного изменения мы можем начать искать генетические биомаркеры для болезни».Другая из любопытных особенностей, которые обнаружил HMP, – то, что даже здоровые люди несут низкие уровни вредных бактерий, но, пока тело остается здоровым,они не вызывают болезнь, они просто сосуществуют вместе с полезными микроорганизмами.Найт сказал, что мы теперь должны узнать почему: что, оказывается, заставляет инфекционные агенты становиться смертельными?

Человеческий проект микробиома (HMP)Консорциум Человеческого проекта микробиома (HMP) является совместной группой из более чем 200 исследователей от 80 научно-исследовательских центров, организованной и финансированнойНациональные Институты Здоровья (NIH) в США. Проект шел с 2007.

Много ученых теперь рассматривают человеческие тела как «сверхорганизмы», накопления сообществ, составленных из человеческих и микробных клеток, сосуществующих в целом этобольше, чем сумма его частей.Идея позади HMP состоит в том, что, потому что микробиом более различен, чем геном и легче изменить, это дает более логическую отправную точку дляиндивидуально кроящее лечение, цель персонализированной медицины.Найт сказал, что HMP пробовал микробиом многих людей, чтобы «получить лучшее представление о вариабельности, и как микроорганизмы сотрудничают в комплексесообщества».

В 2009 команда от Валуна МЕДИ и Вашингтонский университет Медицинская школа в Сент-Луисе, во главе с Рыцарем, издали первый атлас бактериального разнообразиячерез человеческое тело в статье по Науке.Для того исследования они взяли образцы тампона с 27 мест на телах 9 волонтеров и нашли, что у нас люди есть личные бактериальные сообщества этозначительно различайтесь по нашим телам: у тех на нашем лбу есть различная подпись тем на наших ногах, и тем в наших пупках и тем в нашемносы.Новый способ исследовать микробиом

Для недавно изданных исследований 2012 года исследователи HMP пробовали микробиомы 242 здоровых американцев: сбор ткани в три различных раза от 15локализации на теле в 129 мужчинах и с 18 мест в 113 женщинах. Места включали кожу, нос, рот, локти и нижние отделы кишечника.Важной особенностью проекта является метод, исследователи раньше идентифицировали микроорганизмы. Вместо того, чтобы выделить и культивировать человекаинфекционные агенты, они очистили и проанализировали всего человека и ДНК микроорганизма, вместе типовую образцом для более чем 5 000 образцов.

Для анализа они использовали машины упорядочивания ДНК и компьютеры, чтобы искать определенные генетические сигналы, что они знали, присутствовали только у бактерий. Онисигналы прибывают из переменных рибосомных генов у бактерий, что помощь создает клеточные структуры, делающие белки. Используя их смогли исследователипрослеживать подписи различных микробных разновидностей.Используя микробные подписи исследователи HMP могли проигнорировать любые последовательности генома человека и сосредоточиться на бактериальной ДНК.

Другой метод, который они использовали, называют «метагеномным» упорядочиванием. Это упорядочивает ДНК всего микробного сообщества и позволяет, например,исследователи, чтобы изучить метаболические возможности, закодированные в генах микробного сообщества.Ключевые открытия о микробиомеИсследователи HMP установили, что больше чем 10 000 микробных разновидностей населяют человеческую «экосистему».

Найт сказал, что они полагают, что имеют теперьнайденный между 81 и 99% всех родов микроорганизмов в здоровых взрослых американцах.Один из ключевых признаков был абсолютными различиями в микробных сообществах через человеческое тело. Например, микробные сообщества это живет назубы отличаются от тех в слюне.

И самое разнообразное накопление микроорганизмов, как находили, населяло кожу, которая является, вероятно, не, что удивление, потому что кожа является главным барьером междутело и внешний мир.В одном из Изучений природы, во главе с доктором Джеффри Гордоном из Вашингтонского университета, исследователи нашли резкие различия в микроорганизмах пищеварительного тракта

Американцы по сравнению с людьми из других стран, таких как Малави и Венесуэла, во взрослых и детях.Найт сказал, что они только «начинают царапать поверхность» с точки зрения обнаружения, как человеческий микробиом развивается от грудного возраста до взрослой жизни в различномчасти тела и в разных странах.Он сказал, что они особенно интересовались тем, как незападное население не страдает от болезней, которые мы, как правило, связываем с Западным образом жизни, такой какастма, аллергии, ожирение и воспалительное заболевание кишечника.

Другое интересное открытие является открытием генов, влияющих на человеческий метаболизм, большинство из них находится в микробиоме а не в человекегеном.Геном человека имеет приблизительно 22 000 генов для кодирования белков, но человеческий микробиом имеет приблизительно 8 миллионов уникальных генов, кодирующих белки.Результат, мы не могли переварить нашу еду и поглотить жизненные питательные вещества, если бы это не было для бактерий в нашем пищеварительном тракте.Кроме того, бактерии пищеварительного тракта действительно больше, чем ломают еду и ее составляющие как белки, жиры и углеводы, они также производят полезные составы как витаминыи противовоспалительные средства.

И в пределах этой сложности процессов пищеварительного тракта, исследователи HMP сделали другое замечательное открытие: распределение метаболических процессов, обеспеченныхмикроорганизмы более важны, чем который разновидности фактически делают работу.Например, здоровый пищеварительный тракт будет всегда содержать сообщество микроорганизмов, помогающее переварить жиры. Но эта работа не должна быть сделана теми же разновидностямикаждый раз: исследователи сказали, что это походило на бактерии, «действовали в качестве замены» друг от друга.Новое исследование также подтвердило результаты исследования более ранних, меньших исследований: то, что компоненты человеческого микробиома изменяются во время болезни.

Когда aпациент болен или принимает антибиотики, разновидности микробиома могут измениться существенно как одна бактериальная разновидность, или другой затронут. В конечном счете, однако,микробиом приспосабливается к новому состоянию равновесия, даже если предыдущий состав не полностью восстановлен.

Дети с необъясненной лихорадкойОдно из исследований PLoS, во главе с Грегори А Сторчем, профессором Рут Л Ситемен Педиатрии в Вашингтонском университете, исследовало микроорганизмы вносы и кровь детей, заболевающих внезапной, необъясненной лихорадкой.

Это – обычная проблема в младенцах моложе 3, и антибиотики часто даются какпредосторожность, но это также проблематично, потому что она способствует устойчивости к антибиотикам.Исследователи в этом исследовании нашли, что образцы от больных детей имели больше видов вируса, некоторые из них новый, чем образцы от детей без лихорадки,который они также взяли для сравнения.

В то время как лихорадка является одним из способов, которыми тело защищает от вирусов, которые могут вызвать болезнь, это исследование показывает, что даже дети без лихорадки несут вирусы,хотя в более низких числах.Это готовит почву для дальнейшего исследования, чтобы изучить различия между вирусными инфекциями с и без лихорадки, приводя к новым способам применить микробиомзнание в клинике, сказали исследователи.Новые организмы, найденные в пробах фекалий

В другом исследовании PLoS исследователи от Института Генома и Калифорнийского университета, Сан-Франциско, нашли ранее неизвестные группы (таксоны)из микроорганизмов в пробах фекалий от 11 здоровых людей.В то время как они только нашли низкие уровни этих еще названных микроорганизмов, исследователи предполагают, что они, вероятно, довольно распространены, потому что они нашли их в несколькихлюди.Будущие исследования HMPИсследователи HMP теперь планируют клинические исследования, ища связи между микробиомом и болезнью.

Они включают: исследование изменений во влагалищноммикробиом во время беременности; исследуя роль микробиома пищеварительного тракта при неспецифическом язвенном колите, раке пищевода и болезни Крона; дальнейшее расследованиевирусная ДНК в ноздрях детей с необъясненными лихорадками; смотря на микробиом кожи при псориазе, дерматите и иммуннодефиците; ипонимание, как микробиом способствует нарушениям детства как педиатрическая боль в животе и воспаление кишечника.


Пластиковые машины