Во время общеевропейского исследования семейства бактерий Enterobacteriaceae исследователи Центра надзора за геномными патогенами при Институте Велком Сэнгера Фрайбургского университета и их партнеры проанализировали геномы почти 2000 тыс. pneumoniae взяты у пациентов в 244 больницах 32 стран. Результаты, опубликованные сегодня (29 июля 2019 г.) в журнале Nature Microbiology, послужат информационным источником для усилий общественного здравоохранения по борьбе с распространением этих инфекций в больницах по всей Европе.
Подсчитано, что 341 смертельный случай в Европе был вызван устойчивым к карбапенемам калием. pneumoniae в 2007 г .; к 2015 году количество смертей увеличилось в шесть раз и составило 2094 человека.
Большое количество смертей связано с тем, что, когда карбапенемы перестают быть эффективными против устойчивых к антибиотикам бактерий, остается несколько других вариантов. Особому риску подвержены младенцы, пожилые люди и люди с ослабленным иммунитетом.
Обследование является крупнейшим в своем роде и является первым шагом к последовательному эпиднадзору за устойчивыми к карбапенемам бактериями в Европе. Более 2000 образцов K. pneumoniae были собраны у пациентов в 244 больницах и отправлены в институт Wellcome Sanger, где были секвенированы геномы 1700 из них.
Исследователи идентифицировали небольшое количество генов, которые при экспрессии могут вызывать устойчивость к карбапенемным антибиотикам. Эти гены производят ферменты, называемые карбапенемазами, которые «пережевывают» антибиотики, делая их бесполезными.
Беспокойство для общественного здравоохранения вызывает недавнее появление небольшого числа клонов «высокого риска», несущих один или несколько генов карбапенемазы, которые быстро распространились.
Считается, что интенсивное использование антибиотиков в больницах способствует распространению этих высокорезистентных бактерий, которые превосходят другие штаммы, которые легче поддаются лечению антибиотиками.
Доктор София Дэвид, первый автор исследования из Центра надзора за геномными патогенами, сказала: «Подход« Единое здоровье »к устойчивости к антибиотикам фокусируется на распространении патогенов через людей, животных и окружающую среду, включая больницы. Но в случае устойчивой к карбапенемам Klebsiella pneumoniae, наши результаты предполагают, что больницы являются ключевым фактором передачи – более половины образцов, несущих ген карбапенемазы, были тесно связаны с другими, взятыми из той же больницы, что позволяет предположить, что бактерии распространяются из личное общение в основном в больницах."
Образцы устойчивых к антибиотикам бактерий также с большей вероятностью были тесно связаны с образцами из разных больниц в той же стране, а не из разных стран, что позволяет предположить, что национальные системы здравоохранения в целом играют важную роль в распространении этих устойчивых к антибиотикам бактерий. бактерии.
Несмотря на очевидную угрозу, что устойчивый к карбапенемам K. pneumoniae для пациентов, более эффективный инфекционный контроль в больницах, включая рассмотрение того, как пациенты перемещаются между больницами, и меры гигиены, окажут влияние.
Профессор Хайо Грундманн, со-ведущий автор и руководитель Института профилактики инфекций и госпитальной гигиены при Медицинском центре Фрайбургского университета, сказал: «Мы с оптимизмом надеемся, что при хорошей госпитальной гигиене, которая включает раннее выявление и изоляцию пациентов, несущих эти заболевания, бактерии, мы можем не только задержать распространение этих патогенов, но и успешно контролировать их.
Это исследование подчеркивает важность инфекционного контроля и постоянного геномного надзора за устойчивыми к антибиотикам бактериями, чтобы гарантировать, что мы обнаруживаем новые устойчивые штаммы на раннем этапе и принимаем меры для борьбы с распространением устойчивости к антибиотикам."
В настоящее время планируется второе обследование семейства бактерий Enterobacteriaceae в больницах Европы. Полученные данные доступны через MicroReact, общедоступный веб-инструмент, разработанный Центром надзора за геномными патогенами.
MicroReact поможет исследователям и системам здравоохранения составить график распространения устойчивости к антибиотикам среди таких патогенов, как K. pneumoniae и следить за их развитием.
Профессор Дэвид Аненсен, соавтор и директор Центра по надзору за геномными патогенами, сказал: «Геномный надзор будет ключом к борьбе с новыми видами устойчивых к антибиотикам штаммов патогенов, которые были выявлены в ходе этого исследования.
В настоящее время новые штаммы развиваются почти так же быстро, как мы можем их секвенировать. Цель создания надежной сети центров секвенирования генома позволит системам здравоохранения гораздо быстрее отслеживать распространение этих бактерий и их развитие."