Кухонная губка подвергается воздействию самых разных микробов, которые образуют обширный микробиом бактерий. Фаги – самые распространенные биологические частицы на планете, которые обычно встречаются везде, где обитают бактерии. С таким пониманием кухонные губки казались подходящим местом для их поиска.
Студенты исследовательского класса изолировали бактерии из использованных ими кухонных губок, а затем использовали бактерии в качестве приманки для поиска фагов, которые могли бы атаковать их. Двое студентов успешно обнаружили фаги, заражающие бактерии, живущие в их кухонных губках. «Наше исследование демонстрирует ценность поиска любой микробной среды, которая может содержать потенциально полезные фаги», – сказала Брианна Вайс, студентка естественных наук из Нью-Йоркского технологического института.
Исследователи решили «поменять местами» эти два фага и посмотреть, могут ли они заразить изолированные бактерии другого человека. Следовательно, фаги действительно убивали другие бактерии. «Это заставило нас задуматься, были ли штаммы бактерий одинаковыми по совпадению, хотя они произошли от двух разных губок», – сказал Вайс.
Исследователи сравнили ДНК обоих изолированных штаммов бактерий и обнаружили, что оба они принадлежали к семейству Enterobacteriaceae. Эти бактерии принадлежат к палочковидной группе микробов, обычно обнаруживаемых в фекалиях, некоторые из которых вызывают инфекции в больницах.
Хотя штаммы тесно связаны между собой, при проведении биохимического тестирования они обнаружили химические различия между ними.
«Эти различия важны для понимания круга бактерий, которыми может инфицировать фаг, что также является ключом к определению его способности лечить специфические устойчивые к антибиотикам инфекции», – сказал Вайс. «Продолжая нашу работу, мы надеемся выделить и охарактеризовать больше фагов, которые могут инфицировать бактерии из различных микробных экосистем, где некоторые из этих фагов могут быть использованы для лечения устойчивых к антибиотикам бактериальных инфекций."
Этот проект начался как часть студенческого исследовательского класса с семью студентами в Нью-Йоркском технологическом институте (NYIT) в Олд-Вестбери, штат Нью-Йорк. Курс финансировался за счет внутренних грантов, предоставленных (NYIT), который также поддержал нашу более позднюю работу по дальнейшей характеристике изолированных бактерий и бактериофагов.
Этот второй этап нашей работы будет представлен на плакате в ASM Microbe в воскресенье, 23 июня.