Эти данные повлияли на политику здравоохранения в Аргентине, где национальная система эпиднадзора теперь использует полногеномное секвенирование, чтобы различать пандемические и непандемические линии V. холерные бактерии. Исследование опубликовано в Nature Communications сегодня (1 октября).
Холера, вызванная штаммами V. бактерии холеры, в настоящее время поражающие 47 стран мира и уносящие жизни почти 100000 человек в год. С 1800-х годов в мире было семь пандемий холеры, унесших миллионы смертей. Текущая пандемия, начавшаяся в 1960-х годах, вызвана одной линией V. холера, называемая 7PET. В то время как Южная и Центральная Латинская Америка в значительной степени оправились от вспышек, начавшихся на Гаити в 2010 году, эта линия продолжает циркулировать по всему миру и является причиной крупнейшей в мире эпидемии холеры, продолжающейся в Йемене, где были инфицированы сотни тысяч человек.
В новом исследовании команда секвенировала геномы уникального набора исторических V. cholerae, хранящихся в ИНЭЙ-АНЛИС "Др. Карлос Дж. Мальбран, национальная справочная лаборатория Аргентины.
Повторно проанализировав прошлое, международная группа исследователей надеется лучше понять будущие модели заболеваний и обеспечить быстрое оповещение о новых появлении пандемических линий.
Используя филогенетический анализ, они подтвердили, что вспышка холеры в Аргентине в 1992 году была вызвана одним введением 7PET V. бактерии холеры, первоначально завезенные в Перу.
Затем за шесть лет эпидемии бактерии очень мало эволюционировали. Это было в отличие от разнообразных, множественных эндемичных штаммов V. холеры, циркулирующие одновременно. Предыдущая работа группы показала, что, хотя эндемичные штаммы могут вызывать у людей заболевание, у них, похоже, нет потенциала для быстрого распространения и возникновения эпидемии.
Мэтью Дорман, первый автор исследования из института Wellcome Sanger, сказал: «Когда пандемический штамм 7PET попадает в Латинскую Америку из других мест, он может вызвать массовые эпидемии, подобные тем, которые наблюдались в Перу в 1990-х годах и на Гаити в 2010 году. Если мы хотим эффективно бороться с эпидемиями холеры, жизненно важно, чтобы мы могли различать и понимать различия между местными, эндемическими V. cholerae, которые сосуществуют вместе с 7PET во время эпидемии холеры. В нашем исследовании была изучена геномная эволюционная история этих двух типов вместе в одной стране в течение десятилетия, когда в этом регионе произошли крупные вспышки холеры."
Полученные данные были использованы органами общественного здравоохранения Аргентины, где в настоящее время национальная система оповещения была изменена, чтобы различать пандемическую линию 7PET и местную линию V. cholerae с использованием полногеномного секвенирования.
Д-р Хосефина Кампос, старший автор INEI-ANLIS "Dr. Карлос Дж. Мальбран, Буэнос-Айрес, Аргентина, сказал: «Благодаря всеобъемлющей системе эпиднадзора и отчетности справочная лаборатория в Аргентине содержит снимок всей эпидемии. Это дало нам уникальную возможность понять детальную эволюцию V. бактерии холеры в нашей стране.
Мы сможем использовать эти данные и этот опыт для информирования о том, как мы отслеживаем и реагируем на любые будущие вспышки холеры – бактерии, вызывающие эпидемии, представляют совершенно иной риск, чем те, которые этого не делают; это простая информация, которая имеет решающее значение для борьбы с болезнями. Мы первая в мире национальная система отчетности, использующая геномные данные для мониторинга холеры, подобного этой."
Профессор Ник Томсон, старший автор из Института Велком Сэнгер и Лондонской школы гигиены и тропической медицины, сказал: «Подобные подробные исследования способствуют нашему растущему пониманию того, как холера распространяется по всему миру: доказательства для улучшения стратегий борьбы, а также определить области для дальнейших исследований. Наша задача – лучше понять, почему такая простая бактерия продолжает представлять такую угрозу для здоровья человека, с этим исследованием мы стали немного ближе."