Семь белков, которые могут помочь врачам оценить, насколько агрессивный рак пациента и должны ли они получить химиотерапию, были идентифицированы немецкими исследователями.Используя стратегию, подобную алгоритму PageRank Google, исследователи из Дрезденского технического университета, Германия, смогли оценить приблизительно 20 000 белков своим генетическим отношением к развитию рака поджелудочной железы. Исследование издается в PLoS Вычислительная Биология.
Команда использовала их собственную версию алгоритма Google, чтобы идентифицировать новые биомаркеры, которые являются молекулами, произведенными раковыми клетками. Несмотря на то, что биомаркеры могут помочь врачам диагностировать рак ранее, их часто трудно найти и трудоемкий. Кроме того, биомаркеры, найденные в различных исследованиях для тех же типов рака почти никогда, не накладываются.Однако команда смогла избежать этой проблемы при помощи стратегии Google.
Исследователи использовали факт, что белки в клетке связаны через сеть физических и регулирующих взаимодействий; ‘белок Facebook’ так сказать.Зима Кристофа объяснила:«Как только мы добавили сетевую информацию в нашем анализе, наши биомаркеры стали более воспроизводимыми».
Используя алгоритм Google и эту сетевую информацию исследователи нашли значительное совпадение с предыдущим исследованием из Университета Северной Каролины. В этом наложении исследователи смогли идентифицировать белок, который может оценить агрессивность при раке поджелудочной железы.
Прежде чем эти новые биомаркеры могут использоваться в клинической практике, они должны быть утверждены в большем последующем исследовании. Однако одна проблема остается – как превратить это понимание новых лекарств, замедляющих развитие рака.
Клиническая экспертиза на лекарстве от рака поджелудочной железы в настоящее время проводится командой вместе с дрезденской компанией биотехнологии RESprotect.