Международный консорциум ученых завода закончил первое упорядочивание бананового генома.Бананы (Стив Хопсон / www.stevehopson.com)
Банановый геном, как находили, содержал больше чем 36 000 генов, немного больше, чем геном человека. Результаты изданы в журнале Nature.“Мы имеем дело с огромными объемами информации”, сказали соавтор доктор Эрик Лайонс, доцент в Школе Аризонского университета Растениеводства. “Геномы завода невероятно динамичные, который делает их некоторыми самыми захватывающими и в то же время большинством трудных организмов, чтобы учиться”.
Из многих видов банана, научное название которого – заостренный Муса, один названный Паханг DH – порода, известная ее восприимчивостью для болезни, делая его плохим выбором урожая. Избежавший промышленностью сельского хозяйства, Паханг DH повысился до славы, когда упорядочивающая команда, во главе с двумя французскими исследовательскими организациями, CIRAD и CEA-Genoscope, выбрала разнообразие для своего проекта.Банан Паханга DH отличается от своих родственников, в которых он имеет то, что генетики называют гомозиготным геномом.“Это означает, что обе копии каждой хромосомы идентичны”, объяснил доктор Лайонс. “Работа с гомозиготным геномом облегчает решать мозаику генома и правильно собирать все части.
Вы не запутываетесь при наличии немного отличающихся частей загадки или последовательностей, для генных аллелей через геном”.По данным консорциума, бананы жизненно важны для еды и экономической безопасности больше чем 400 миллионов человек в южных странах, но они испытывают постоянное давление со стороны ряда паразитов. То давление особенно высоко в плантациях, производящих ‘экспортные’ бананы, которые мы находим в наших супермаркетах. Это делает крайне важным развивать новые, более стойкие варианты, хотя это – сложная операция, учитывая очень низкое изобилие культурных банановых видов.
Недавно доступная последовательность генома обеспечивает доступ к каждому из генов завода и к их позиции по его 11 хромосомам. Консорциум сообщил в заявлении, что это знание сделает намного легче определить гены, ответственные за знаки, такие как фруктовое качество и сопротивление болезни. Наконец, это будет жизненный инструмент для улучшения банановых видов, используя много генетических ресурсов, доступных во всем мире.Банан – первое нетравянистое растение в своем ботаническом классе, моносемядоли, весь геном которых был упорядочен.
Однодольные растения включают травы, пальмы, лилии и другие растения главным образом мясистой высоты. Двудольные растения, с другой стороны, включают больше эволюционных недавних заводов включая большинство цветущих растений и всех истинных деревьев.“Банан – первый геном однодольного растения, который мы упорядочили, это не от хлопьев”, сказал доктор Лайонс. “Это дает нам хорошую возможность сравнить эту группу с ее дальними родственниками и лучше понять эволюцию происхождения однодольного растения”.
Уже, исследователи были в состоянии установить тот банан, видел три эпизода полного дублирования генома, по крайней мере два из которых независимы от замеченных в травах. В отличие от этого, в животном мире, дублируя весь геном ничего необычного в мире завода.“Мы иногда шутим, что Вы, как только Вы даете заводу забавный взгляд, это удваивает свой весь геном”, сказал доктор Лайонс.
Это явление, названное полиплоидией, является одной из главных причин, почему геномы завода представляют собой проблему для ученых как доктор Лайонс, которые интересуются пониманием, как геномы изменились за эволюционное время и связывают это с функцией организма.